Systemy operacyjne Windows, Mac, Linux posiadają pliki systemowe, takie jak dynamiczne pliki bibliotek. Inne typy plików systemowych to ikony, motywy (komobinacje tła, kolorystyki i dźwięku), sterowniki urządzeń (programu kontrolujące sprzęty podłączone do kompuera)
Do tej kategorii zalicza się też pliki wyjściowe. Popularne rozszerzenia to .DLL, .CPL, .SYS i .DRV.