Na rynku istnieje znany program nazwany ChemDraw, który jest stosowany do celów projektowania struktury cząsteczki. Oznacza to, że jest oprogramowaniem specjalistycznym z dziedziny chemii. Informacje chemiczne zawarte są w plikach utworzonych przez ten program, a zapisywanych w formacie .CDX.
Do wymiany danych zawartych w plikach .CDX między różnymi komputerami służy osobny format .CDXML.